โซนภาคเหนือ
– พิษณุโลก ยูนิตี้ แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 2 ครั้งแรกในนาม วัดโบสถ์ ซิตี้ 2019)
– แม่โจ้ ยูไนเต็ด รองแชมป์ เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งแรก
โซนภาคตะวันออก
– สายมิตรกบินทร์ ยูไนเต็ด แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งแรก)
– บ้านค่าย ยูไนเต็ด รองแชมป์โซนภาคตะวันออก เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 3 ครั้งแรกปี 2018 , ครั้งที่สองปี 2019
โซนภาคตะวันออกเฉียงเหนือ
– ศรีสะเกษ ยูไนเต็ด แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 4 ครั้งแรกปี 2012 , ครั้งที่สองปี 2017 , ครั้งที่สามปี 2022-23)
– มหาสารคาม เอสบีที รองแชมป์ ( เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 2 ครั้งแรก ปี 2022-23)
โซนกรุงเทพ
– บางกอก เอฟซี แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 5 ครั้งแรก ปี 2010 , ครั้งที่สอง ปี 2020-21 , ครั้งที่สาม ปี 2021-22 , ครั้งที่สี่ ปี 2022-23)
– ม.นอร์ทกรุงเทพ รองแชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 7 ครั้งที่แรก ปี 2011 , ครั้งที่สอง ปี 2017 , ครั้งที่สาม ปี 2018 , ครั้งที่สี่ ปี 2020-21, ครั้งที่ห้า ปี 2021-22 , ครั้งที่หกปี 2022-23
โซนภาคตะวันตก
– ม.ปทุมธานี แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 3 ครั้งแรก ปี 2019 , ครั้งที่สองปี 2021-22
– อ่างทอง เอฟซี รองแชมป์โซนภาคตะวันตก เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 2 ครั้งแรกปี2013
โซนภาคใต้
สงขลา เอฟซี แชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 3 ครั้งแรก ปี 2020-21, ครั้งที่สอง ปี 2022-23
พัทลุง เอฟซี รองแชมป์ (เข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกครั้งนี้ครั้งที่ 2 ครั้งแรก ปี 2011)
หลังจากได้ครบตัวแทนจากทุกโซนคือแชมป์และรองแชมป์แล้ว รวม 6 โซนคือ 12 ทีม จะทำการแข่งขันรอบแชมเปี้ยนส์ลีก ซึ่งจะแบ่งเป็น 2 โซนคือ โซนบน 6 ทีม ประกอบด้วย ตัวแทนจากภาคเหนือ, ภาคอีสาน และภาคตะวันออก ส่วนโซนล่าง 6 ทีมประกอบด้วย ตัวแทนจากกรุงเทพและปริมณฑล, ภาคตะวันตก และภาคใต้ โดยคัดเอาแค่ 3 ทีมเลื่อนชั้นสู่ไทยลีก 2
การแข่งขันรอบแชมเปี้ยนส์ลีก ทั้ง 2 โซนจะเตะพบกันหมดแบบเลกเดียว ทีมแชมป์ของแต่ละโซนจะได้เป็นเจ้าบ้าน 3 นัด และรองแชมป์ของแต่ละโซนจะได้เล่นในบ้าน 2 นัด ทีมที่เป็นแชมป์ในรอบแชมเปี้ยนส์ลีกของโซนบนและโซนล่างจะได้เลื่อนชั้นสู่ไทยลีก 2 รวม 2 ทีม ส่วนโควตาเลื่อนชั้นอีก 1 ทีมจะนำรองแชมป์โซนบนและโซนล่างมาเตะแบบเหย้า-เยือน เพื่อหาทีมชนะเลื่อนชั้นขึ้นไปไทยลีก 2 เป็นทีมสุดท้าย โดยกำหนดเตะรอบแชมเปี้ยนส์ลีกคือ วันที่ 9 มี.ค. -7 เม.ย. 2567
สำหรับแชมป์โซนบนและล่างที่ได้เลื่อนชั้นไปแล้ว แต่ต้องมาเตะเพื่อหาแชมป์ประเทศไทย โดยเตะแบบเหย้า-เยือน นัดแรก วันที่ 20-21 เม.ย. 2567 และนัดที่สอง 27-28 เม.ย. 2567 เช่นเดียวกับเพลย์ออฟของรองแชมป์ที่ต้องแย่งอันดับ 3 ที่เป็นตั๋วใบสุดท้ายขึ้นไทยลีก 2 เป็นช่วงเวลาเดียวกัน
ส่วนการจับสลาก รอบแชมเปี้ยนส์ลีก จะมีขึ้นในที่ 27 ก.พ. 2567